姚端正教授長期在武漢大學(xué)物理學(xué)院承擔(dān)本科生“數(shù)學(xué)物理方法”、“計(jì)算物理”，以及研究生“量子光學(xué)”、“計(jì)算物理II”等課程的教學(xué)。她潛心于教學(xué)改革與課程建設(shè)，取得了一系列的教學(xué)成果。其作為帶頭人的“物理基礎(chǔ)核心理論課程教學(xué)團(tuán)隊(duì)”獲評(píng)為國家級(jí)教學(xué)團(tuán)隊(duì)；其主講并作為課程責(zé)任教授的“數(shù)學(xué)物理方法”課程，被評(píng)為國家精品課程和國家精品資源共享課程；以她為第一完成人的教學(xué)改革成項(xiàng)目，曾獲國家級(jí)教學(xué)成果獎(jiǎng)二等獎(jiǎng)、湖北省高校教學(xué)成果一等獎(jiǎng)。她以第一作者編寫出版教材六本，其中的《數(shù)學(xué)物理方法》，第一版獲國家教委優(yōu)秀教材二等獎(jiǎng)，第二版獲教育部科技進(jìn)步獎(jiǎng)二等獎(jiǎng)，第三版先后入選為國家“十一五”規(guī)劃教材和國家“十二五”規(guī)劃教材。

姚端正教授長期從事非線性光學(xué)和數(shù)學(xué)物理領(lǐng)域的科研工作，主要從事量子限制結(jié)構(gòu)的瞬態(tài)相干光學(xué)效應(yīng)的理論研究和光纖中非線性光傳輸特性的解析研究。主持或承擔(dān)過省自然科學(xué)基金、國家自然科學(xué)基金以及其它科研項(xiàng)目。已培養(yǎng)碩、博士研究生30余名，在Physical Review A，Applied Physics Letters，Applied Physics B等國內(nèi)外重要學(xué)術(shù)刊物上發(fā)表論文80余篇。